При использовании минеральных и органических удобрений для повышения урожайности в сельском хозяйстве возрастает опасность загрязнения воды, почвы и оказывается негативное воздействие на другие компоненты окружающей среды, включая нарушение естественного баланса микрофлоры почвы. Реальные экологические последствия использования удобрений зависят от методов борьбы с загрязнением, типа почвы и растений, а также метеорологических условий. Анализ данных о внесении удобрений (временных рядов) позволяет контролировать воздействие на окружающую среду.